琼瑶7年前就曾发表一封公开信交代后事，包括“所有迷信的事都不要做”等5点事项：
一、 不要用任何宗教的方式来悼念我。
二、 将我尽快火化成灰，采取花葬的方式，让我归于尘土。
三、 不发讣文、不公祭、不开追悼会。私下家祭即可。死亡是私事，不要麻烦别人，更不可麻烦爱我的人——如果他们真心爱我，都会了解我的决定。
四、 不做七，不烧纸，不设灵堂，不要出殡。我来时一无所有，去时但求干净利落！以后清明也不必祭拜我，因为我早已不存在。何况地球在暖化，烧纸烧香都在破坏地球，我们有义务要为代代相传的新生命，维持一个没有污染的生存环境。
五、 不要在乎外界对你们的评论，我从不迷信，所有迷信的事都不要做！“死后哀荣”是生者的虚荣，对于死后的我，一点意义也没有，我不要“死后哀荣”！后事越快结束越好，不要超过一星期。等到后事办完，再告诉亲友我的死讯，免得他们各有意见，造成你们的困扰！
12月5日，琼瑶的家人发文表明会遵从遗愿：“告别式将不设公祭，也不举行任何媒体会或纪念活动，不占用社会资源。”所以，琼瑶的葬礼大家也没见到有几位明星。
日前，琼瑶秘书还晒出了琼瑶告别之际就给她的绝笔信，字迹清晰有力。她在信中称呼秘书，既是她的秘书又是她的女儿，表达了深厚的情感。琼瑶让秘书在她死后帮她把遗书和视频发出去，自己的身后事被她安排的明明白白。
琼瑶离世后，她所居住的房屋近期也备受关注。不少人都吐槽她的自杀行为，在家里烧炭或开煤气很“自私”，因为一旦引发爆炸或火灾，后果不堪设想，而且在家里自杀，还会让住宅变成凶宅。
台北当地的房产公司表示，琼瑶的住处符合内政部函示提及“持有期间”、“专有部分”、“非自然身故”的凶宅定义，不过，由于个案状况特殊，结果可能和一般凶宅不同。
据悉，目前台北市场上凶宅分成大凶、中凶、小凶等状态，对房价造成不同影响。例如凶杀案价格会比轻生案来得更低，纵然是轻生案也会考量个案状态，价格影响幅度则多在5折到7折之间。过去凶宅的接手者多为投资客拿来出租，或是公司用来当写字楼，买家相对局限。
不过，琼瑶在华人社会有独特地位，拥有庞大粉丝。放眼全球，不乏有名人过世后，粉丝以高价取得其故居，以缅怀偶像的案例，此豪宅是否会出现具有实力，且不在意凶宅的粉丝想接手，有待观察。
尤其琼瑶选择以平静、自主方式离世，和一般轻生大为不同，加上该位置面对宽阔河面，阳台可远眺观音山落日夕阳等美景，曾被外媒评为“少数世界顶尖风景之一”，如此条件，极可能吸引特殊买家想要接手。
房产人士表示，凶宅虽然客观条件不像海砂、辐射直接对住户产生危险，但“心理性”影响不容小觑，在不动产交易中被视为重大瑕疵之一，银行端多数不愿意给凶宅贷款，买方必须负担全额现金，转手性也必然受影响，价格不容易有所表现。
除了琼瑶的淡水豪宅，琼瑶一生创作的作品为她积累大量财富，仅《还珠格格》就多次被翻拍成电视剧，有媒体估计琼瑶版权总费用至少超过10亿元人民币。由于琼瑶离世前并无明确透露财产分配，留下来的巨额版权费也成为外界关注焦点。对此，儿媳何琇琼发声，“严禁投机行为，遏制侵权”，简短10字声明强调版权的唯一来源。
据悉，琼瑶丈夫平鑫涛的遗产都给了他和前妻的孩子，没有留给自己的老婆琼瑶，继子享受了琼瑶的好处最后还骂她。琼瑶选择不与平鑫涛合葬，用生命最后的倔强诉说着内心的不甘。琼瑶下葬后，接下来各界将会更多关注她的遗产怎么分配。
30多年前，琼瑶曾苦劝比她小5岁的三毛（原名：陈平）珍惜生命。当时三毛在失去荷西后，精神状态不佳，甚至准备殉情，琼瑶邀三毛到家中，苦劝她“要好好活下去”。
二人在文坛成就相当、年龄相仿，一下聊了7个小时，直到得到三毛承诺放弃轻生念头，琼瑶才让她回家，事后还不放心地打电话追问三毛，反复确认是否信守承诺，得到肯定答案才放下电话。但后来，三毛仍在荷西过世12年后的1991年，也追随荷西而去，
没想到在2024年末，琼瑶走上同样的路，两位好姐妹在天堂可以相聚了！