琼瑶有两段婚姻。

她的第一段婚姻是和作家庆筠。1959年，喜欢写作的琼瑶认识了庆筠，他对琼瑶的写作帮助很大，两人两情相悦，随后结婚，并生下儿子陈中维。琼瑶在空闲时间继续写作，出版了小说《情人谷》。1963年，琼瑶在一次电视台邀请采访过程中，遇到了《皇冠》杂志社社长平鑫涛。1964年，琼瑶与庆筠离婚。

琼瑶的第二段婚姻对象是平鑫涛。平鑫涛出生于1927年，是《皇冠》杂志社的社长，他与前妻育有两个女儿和一个儿子。平鑫涛被琼瑶的才华和气质深深吸引，在日常交往中，两人感情越来越深。后来他向妻子林婉珍提出离婚，在儿子的劝说下，林婉珍同意了离婚，三个孩子都由女方抚养。1979年，平鑫涛与比自己小11岁的琼瑶结婚。2019年，平鑫涛在台湾去世。

琼瑶和平鑫涛的爱情故事背后，确实有着林婉珍的存在。1963年，平鑫涛作为《联合报》副刊责编，与投稿的琼瑶神交已久。后来琼瑶以新锐作家身份受邀到平家做客，此后她凭借《窗外》成为畅销作家，并从高雄搬到台北，在平家对面租屋。

林婉珍在她的自传《往事浮光》中提到，琼瑶会穿着新买的衣服到家里问平鑫涛好不好看，还会特地打电话问平鑫涛要不要吃牛肉干等，这些行为让林婉珍感到不适，也逐渐察觉到琼瑶对自己婚姻的介入。

后来平鑫涛恋上琼瑶后，竟要求林婉珍带着琼瑶去就诊换药，之后还带着琼瑶旅欧一个月。而林婉珍为了三个孩子选择强忍屈辱，期待丈夫迷途知返，但未能如愿。林婉珍曾想过轻生，甚至一度想从桥上跳下去，但为了年幼的孩子最终放弃。

她后来与琼瑶见面密谈希望琼瑶退出，但琼瑶反而一直在跟平鑫涛秀恩爱，还跟林婉珍说“那你来我家把他带走呀”。林婉珍无奈强撑婚姻，操持家务，试图挽回平鑫涛，苦撑12年后于1979年离婚。此后未再婚，投身绘画，成了台湾小有名气的画家。

2018年，88岁的林婉珍出版自传《往事浮光》，将这段往事公之于众，表达了自己多年来的委屈和对琼瑶的控诉。琼瑶在沉默一天后回应，贴出一段和尚开示徒弟的短片，写道“所谓爱一个人，就是给了他伤害你的权利”“分开只因为，它们不再合适啦”“分手就是分手，错对没有意义。不再合适的两个人，与其耗尽对方养分一同枯萎，不如坦然聚散各自相安，一切的一切都要看缘份哪”等话语，暗示林婉珍看开点。并在平台发文“前人种树后人乘凉”，疑似隐喻平家儿女接管皇冠集团等事。

平鑫涛去世后，将财产的一部分留给了他跟林婉珍的子女，让子女继承了皇冠集团。不过平鑫涛将位于台湾台北市的一栋价值25亿新台币（约合5.5亿人民币）的别墅“可园”留给了琼瑶，并留下了6亿人民币的现金包括皇冠影业公司归琼瑶所有。而琼瑶去世后留下了巨额财产25亿，据媒体报道，琼瑶并没有对遗产做过交代。琼瑶只有一个儿子陈中维，跟前夫庆筠所生，若继子女与琼瑶构成扶养关系则有继承权，否则陈中维将继承大部分遗产。